随着货运代理企业经营模式的改变和计算机技术的发展，货运系统正逐步向管理一体化、网络化、外部化、多功能数据接口的方向发展。
货运系统已从初的制单功能逐步发展到综合文档管理和多功能输出（打印、传真、电子邮件、MSN、存储文档、批量输出）、货物状态管理、付款管理、结算管理、管理、会计管理等；从输出基本的数据统计报表到数据图形报表、智能报表、辅助决策分析等；从企业管理到行政管理（OA）、客户服务（EB）等职能。货运软件的集成功能越来越多，模块功能越来越详细。这也提高了货运软件供应商的准入门槛。由成熟的货运系统供应商提供的货运系统，业务流程流畅，功能细致，人性化。
随着货运代理公司逐步向集团化发展，系统提出了数据集中和分布管理的要求。也就是说，数据需要集中存储在同一台服务器上，每个分支需要独立管理数据。当然，这对服务器和带宽的要求也很高。此外，联网还体现在一些数据可以随时在线查询，方便公司经理或人员出差时管理数据。
货运系统正逐渐从单一的解决方案转变为企业内部的业务，转变为整个物流供应链各个环节的信息交互，并建立一个行业共同体环境。例如，与工厂外贸公司、外贸工厂、航运公司、航空公司、保险公司、银行、车队、报关行、货运代理、仓储公司等进行信息交互。同时，货运软件制造商试图打破原有软件制造商无法与数据交互的局面，建立软件联盟，并通过集成建立统一的数据接口，确保联盟中的软件用户能够实现数据连接，从而催生数据物流等新服务。
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